תכונה חיונית נוספת של סמארטפונים היא הזמינות של אפליקציות מובייל שונות.יישומים ניידים, המכונים בדרך כלל 'אפליקציות', הן תוכנות המיועדות לבצע משימות ספציפיות בסמארטפונים.יש היום אפליקציה זמינה כמעט לכל דבר, החל מאפליקציות בידור ומשחקים ועד לאפליקציות פרודוקטיביות וחינוכיות.
חנויות אפליקציות, כגון Apple App Store ו-Google Play Store, מאפשרות למשתמשים לגלוש ולהוריד מגוון רחב של אפליקציות של צד שלישי שנועדו לתת מענה לצרכים שונים של משתמשים.אפליקציות אלה נעות בין חינמיות לתשלום ומציעות תכונות ופונקציות שונות.אפליקציות מסוימות עשויות לדרוש גישה לתכונות מסוימות של הטלפון, כגון המיקרופון, המצלמה או שירותי המיקום.
אחת האפליקציות הנפוצות ביותר לנייד היא אפליקציות רשתות חברתיות.אפליקציות כמו פייסבוק, אינסטגרם, טוויטר וסנאפצ'ט פופולריות בקרב משתמשים בכל הגילאים מכיוון שהן מאפשרות להם להתחבר ולתקשר עם חברים ובני משפחה באופן מיידי.אפליקציות רשתות חברתיות מאפשרות למשתמשים לשתף תמונות, סרטונים ועדכונים עם אנשי הקשר שלהם ולעקוב אחר חשבונות המעניינים אותם.
קטגוריה פופולרית נוספת של אפליקציות לנייד היא אפליקציות משחק.המשחקים הניידים הפכו פופולריים יותר ויותר עם השנים, וסמארטפונים הפכו לפלטפורמת משחקים פופולרית.משחקים כגון Candy Crush, Angry Birds ו-Fortnite הפכו לשמות מוכרים בקרב גיימרים בכל הגילאים.
אפליקציות פרודוקטיביות, כגון Microsoft Office, Evernote ו-Trello, הן גם פופולריות בקרב משתמשי סמארטפונים.אפליקציות אלו מאפשרות למשתמשים להישאר מאורגנים ופרודוקטיביים, לנהל משימות ולשתף פעולה עם אחרים ביעילות.סוגים אחרים של אפליקציות לנייד כוללים אפליקציות חינוך, אפליקציות נסיעות, אפליקציות מזון ומשקאות ואפליקציות בריאות וכושר.
בנוסף לסוגי האפליקציות השונים הזמינים, אפליקציות מובייל מציעות גם מספר יתרונות לעסקים.יישומים ניידים משמשים ככלי שיווקי יעיל שכן הם מספקים לעסקים פלטפורמה להתחבר ישירות ללקוחותיהם.אפליקציות לנייד מציעות גם הזדמנויות מיתוג, מכיוון שעסקים יכולים להתאים אישית את האפליקציות שלהם עם הצבעים, הלוגו והתכונות הייחודיים שלהם.